34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1768 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  820    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  21.73 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  26.01 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  23.97 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  25.19 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  25.28 
 
 
445 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  29.58 
 
 
442 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  23.3 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  24.51 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  25.66 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  23.39 
 
 
450 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  25.66 
 
 
431 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  24.27 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  24.24 
 
 
448 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  23.86 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  25.93 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  24.06 
 
 
449 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  23.38 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  24.44 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  20.16 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  23.6 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  35.71 
 
 
442 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  26.36 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  22.75 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  30.61 
 
 
440 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 
523 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  23.26 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  33.67 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  21.88 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  23.97 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  23.57 
 
 
443 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  20.34 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 
464 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>