43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0190 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  84.3 
 
 		 449 aa  780    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  919    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  67.26 
 
 		 431 aa  631  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  67.04 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  67.94 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  66.07 
 
 		 434 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  65.47 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  65.92 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  62.78 
 
 		 436 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  61.41 
 
 		 443 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  62.38 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  59.73 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  60.05 
 
 		 443 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  59.08 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  50 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  50.12 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  42.89 
 
 		 442 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  38.79 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  39.6 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  39.11 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  38.28 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  43.26 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  35.66 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  37.05 
 
 		 443 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  34.78 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  26.62 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  25.45 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  22.25 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  23.43 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.5 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  23.35 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  22.5 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  26.63 
 
 		 440 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  23.88 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  22.71 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  23.41 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  25.16 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  25.06 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.57 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  21.66 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  24.24 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.46 
 
 		 913 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3939  hypothetical protein  31.58 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>