42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2562 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  43 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  45.59 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  43.8 
 
 		 432 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  43.26 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  46.19 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  44.25 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  43.87 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  43.14 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  43.96 
 
 		 445 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  44.17 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  43.46 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  45.66 
 
 		 441 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  42.26 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  42.54 
 
 		 443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  39.51 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  39.56 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  32.41 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  29.87 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  28.64 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  29.86 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  28.03 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  28.67 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  27.87 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  27.09 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  26.34 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  29.76 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  26.63 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  28.26 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  26.6 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  27.48 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  26.51 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  26.02 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  27.78 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  23.67 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  27.78 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  24.65 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 998 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 981 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>