42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0391 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  901    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  57.79 
 
 
442 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  43.41 
 
 
444 aa  412  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  41.45 
 
 
443 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  41.48 
 
 
438 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  39.44 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  39.46 
 
 
433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  40.88 
 
 
445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  40.74 
 
 
431 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  38.28 
 
 
448 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  37.88 
 
 
446 aa  316  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  39.14 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  40.39 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  39.81 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  39.13 
 
 
434 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  37.67 
 
 
449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  39.17 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  41.04 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  37.88 
 
 
443 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  38.55 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  37.26 
 
 
443 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  36.69 
 
 
441 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  35.58 
 
 
443 aa  279  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  34.18 
 
 
441 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  32.41 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  27.56 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  24.75 
 
 
444 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  26.3 
 
 
441 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  25.06 
 
 
442 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  23.5 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  27.33 
 
 
440 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  25.31 
 
 
450 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  25.35 
 
 
436 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  25.24 
 
 
440 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  26.42 
 
 
441 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.69 
 
 
424 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.82 
 
 
430 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.36 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  24.59 
 
 
464 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.75 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  35.71 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
998 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>