42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4979 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  69.66 
 
 		 443 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  884    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  68.48 
 
 		 441 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  67.35 
 
 		 443 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  59.78 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  62.65 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  61.38 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  61.95 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  62.38 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  60.09 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  60.32 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  62.06 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  59.16 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  55.73 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  49.44 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  48.76 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  42.24 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  38.11 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  41.73 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  38.21 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  39.43 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  38.55 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  43.46 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  35.46 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  32.68 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  27.46 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  27.06 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  29.04 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  27.87 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  26.51 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  25.54 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  26.67 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.19 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.54 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.08 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  25.79 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  24.39 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  24.07 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  22.93 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  23.15 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  22.76 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  32.89 
 
 		 1788 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>