43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1205 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 444 aa  873    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  38.39 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  37.19 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  38.69 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  38.67 
 
 		 442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  38.41 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  36.21 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  34.05 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  38.08 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  35.37 
 
 		 435 aa  230  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  34.62 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  36.47 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  33.73 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  35.32 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  33.09 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  24.64 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  25.19 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  24.75 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  25.81 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  24.15 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  23.09 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  22.19 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  27.94 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  21.7 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  28.81 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  24.94 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  26.12 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  28.9 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  28.25 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  24.23 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  26.87 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  27.48 
 
 		 434 aa  96.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  27.8 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  26.9 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  26.75 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  26.92 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  25.37 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  26.3 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  24.32 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  24.94 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  28.52 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3939  hypothetical protein  27.08 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  23.5 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>