43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0223 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  62.68 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  61.75 
 
 		 449 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  62.3 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  61.97 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  62.7 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  62.06 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  61.36 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  60.56 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  61.03 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  60.56 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  61.5 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  59.12 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  59.08 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  50.47 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  49.89 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  44.04 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  39.01 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  38.44 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  37.16 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  39.14 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  38.55 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  37.21 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  46.19 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  34.42 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  26.77 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  27.84 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  27.57 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.54 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  29.24 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  28.43 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  26.12 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.55 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  26.45 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  25.38 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  24.51 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  23.84 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  23.26 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  22.95 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  24.71 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  24.72 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  33.7 
 
 		 981 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 998 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>