43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1077 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  910    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  53.48 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  52.36 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  56.09 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  53.97 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  55.31 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  51.35 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  52.36 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  49.44 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  52.23 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  52.93 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  49.44 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  50.11 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  50.12 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  49.89 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  45.74 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  41.4 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  39.25 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  43.7 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  39.68 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  39.28 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  37.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  40 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  34.84 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  39.56 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  24.63 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  25.49 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  27.78 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  29.01 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  26.37 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.61 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  26.33 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  26.33 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  28.87 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  28.4 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  26.1 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.34 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  27.59 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  24.94 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  27.36 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  38.16 
 
 		 1788 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1769  hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>