42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2956 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 442 aa  862    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  64.41 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  62.16 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  59.28 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  58.74 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  56.37 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  46.99 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  37.94 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  36.76 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  34.77 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  35.94 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  38.39 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  34.23 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  36.34 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  32.86 
 
 		 440 aa  236  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  24.5 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  26.88 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  25.99 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  24.18 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  25.06 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  26.51 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  28 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  21.35 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  26.13 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  26.41 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  24.03 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  25.31 
 
 		 445 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  25.78 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  26.34 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  26.44 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  24.45 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  24.88 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  20.75 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  24.13 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  23.88 
 
 		 448 aa  90.1  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  20.9 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  19.63 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  28.93 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  23.6 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  19 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  26.6 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  26.12 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>