42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  70.95 
 
 		 449 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  77.26 
 
 		 432 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  78.62 
 
 		 436 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  74.77 
 
 		 434 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  88.86 
 
 		 431 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  71.69 
 
 		 445 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  94.9 
 
 		 431 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  67.04 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  65.68 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  62.65 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  62.07 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  61.97 
 
 		 423 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  60.69 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  53.92 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  55.31 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  43.12 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  38.94 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  38.43 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  36.99 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  39.81 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  45.59 
 
 		 406 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  37.23 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  34.2 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  31.4 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  26.21 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  25.31 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  26.21 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  25.43 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  26.44 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  28.81 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  24.4 
 
 		 450 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  26.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  24.79 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  23.95 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  24.16 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  26.71 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.93 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.25 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  25.66 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1769  hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>