40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4171 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  68.19 
 
 		 433 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  897    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  78.26 
 
 		 437 aa  732    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  43.56 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  42.99 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  43.7 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  40.28 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  40.99 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  41.48 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  39.02 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  39.15 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  37.88 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  39.9 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  38.43 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  37.41 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  38.28 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  38.11 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  38.43 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  39.01 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  38.95 
 
 		 432 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  39.19 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  39.11 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  37.38 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  36.61 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  29.86 
 
 		 406 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.55 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  24.53 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  23.82 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  22.19 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  25.66 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  24.94 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  24.53 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  22.54 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  22.3 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  19.63 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  22.17 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  21.63 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  19.61 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  19.66 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  21.65 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>