41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2228 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  78.26 
 
 		 438 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  889    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  66.36 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  44.39 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  41.98 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  43.24 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  41.12 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  39.68 
 
 		 446 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  39.44 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  38.77 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  38.66 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  38.79 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  36.57 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  38.76 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  38.21 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  37.53 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  38.44 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  37.59 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  37.29 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  36.99 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  37.65 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  36.9 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  36.84 
 
 		 441 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  36.55 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  28.03 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  25.06 
 
 		 435 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  23.73 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  23.71 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  21.7 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  23.46 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  22.63 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  23.89 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  20.58 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  23.39 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  18.18 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  21.12 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  20.92 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  20.14 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  17.76 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  20.1 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  25.07 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>