43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  68.79 
 
 
441 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  62.53 
 
 
436 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  63.55 
 
 
464 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  64.19 
 
 
442 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  59.08 
 
 
424 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  54.09 
 
 
441 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  36.91 
 
 
435 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  38.5 
 
 
430 aa  266  7e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  38.59 
 
 
435 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  37.97 
 
 
450 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  36.08 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  37.5 
 
 
450 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  38.41 
 
 
444 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  34.75 
 
 
440 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  22.05 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  25.48 
 
 
444 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  26.54 
 
 
442 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  27.33 
 
 
442 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  29.51 
 
 
434 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  26.67 
 
 
443 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  27.68 
 
 
441 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  28.17 
 
 
431 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  29.05 
 
 
431 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  28.87 
 
 
446 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  28.81 
 
 
431 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  28.25 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  28.3 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  28.1 
 
 
432 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  26.33 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  25.79 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  23.23 
 
 
441 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  26.45 
 
 
423 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  26.63 
 
 
448 aa  87  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  26.56 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  22.17 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  23.4 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  25.71 
 
 
449 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  27.84 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  21.12 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  27.48 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  30.61 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1769  hypothetical protein  27.45 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>