36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0568 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0568  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0253119 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.01 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  25.26 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0407  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.99 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  21.33 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  23.79 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  21.33 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  20.87 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  20.5 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  20.87 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  22.82 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  21.52 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  19.73 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  21.72 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  23.12 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  21.34 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  22.65 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  22.61 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  25.53 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  21.55 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  23.74 
 
 		 574 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  24.47 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  24.47 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  24.47 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  24.47 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  24.47 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  24.47 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  20 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  21.72 
 
 		 335 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>