221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4184 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4184  Methyltransferase type 11  100 
 
 
225 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  49.54 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  45.73 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  45.37 
 
 
326 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  44.3 
 
 
277 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
292 aa  151  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  45.8 
 
 
293 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  46.19 
 
 
281 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  48.02 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  46.67 
 
 
295 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.8 
 
 
279 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1348  Methyltransferase type 11  50.45 
 
 
287 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0109621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  39.76 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  48.68 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  48.23 
 
 
277 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  50.44 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  48.68 
 
 
281 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  48.33 
 
 
295 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  40.6 
 
 
300 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.56 
 
 
309 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  48.02 
 
 
289 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  41.36 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  41.2 
 
 
302 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.26 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  35.82 
 
 
269 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  35.47 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.48 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  36.22 
 
 
269 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  44.68 
 
 
267 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27750  predicted protein  40 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.346942  normal  0.638554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.47 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  42.57 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  35.47 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  35.47 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.75 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  34.33 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  34.33 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  34.33 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  35.92 
 
 
286 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.45 
 
 
282 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  43.26 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.66 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.75 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  32.09 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.03 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  32.24 
 
 
276 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.86 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  31.35 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.8 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  31.37 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  31.86 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  29.85 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  29.85 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  29.85 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.43 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.09 
 
 
270 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.11 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  26.52 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  29.47 
 
 
271 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  27.54 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  28.51 
 
 
271 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  33.95 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  34.34 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  34.34 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  34.34 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  34.34 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31 
 
 
285 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  28.33 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  28.45 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  28.36 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  28.99 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  28.5 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 
282 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.58 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  30.11 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.63 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  31.47 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  36.73 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  23.32 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  27.23 
 
 
317 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  26.13 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  25.33 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  28.04 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  38.78 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  27.09 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  30.04 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.41 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  30.71 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  28.5 
 
 
290 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  28.97 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  25.56 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.91 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  29.5 
 
 
277 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.66 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 
291 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  29.51 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  23.11 
 
 
313 aa  52  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>