167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6121 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  100 
 
 		 311 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  55.85 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  48.66 
 
 		 281 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  44.84 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  49.32 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  49.83 
 
 		 282 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  47.54 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.09 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.73 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.61 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  44.41 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.93 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  41.52 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  47.48 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  46.64 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  42.38 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  42.86 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.04 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1348  Methyltransferase type 11  44.69 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0109621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  37.06 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  40.14 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.78 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.36 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.18 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.05 
 
 		 270 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.11 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  30.23 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.68 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  30.23 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  30.23 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  30.23 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  31.79 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4184  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  31.02 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  34.4 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  37.33 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.2 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  29.78 
 
 		 268 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  32.16 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  32.27 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.27 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.84 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.38 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  32.27 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  27.48 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  31.46 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  30.49 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  30.91 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  31.91 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  31.91 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  31.91 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  32.59 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  30.71 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  25.83 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  29.09 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.94 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.89 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  29.1 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  29.1 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  29.1 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  28.29 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  28.16 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  29.69 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  28.64 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  25.23 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  28.52 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  29.46 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.75 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  27.17 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  25.1 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  27.68 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.92 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.22 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  27.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.53 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  27.69 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  27.24 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  26.54 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  26.92 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  27.42 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.01 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  29.82 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.96 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.97 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  26.46 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  30.26 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  25.83 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  23 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27750  predicted protein  33.89 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.346942  normal  0.638554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  23.5 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>