131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2254 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
273 aa  563  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
285 aa  214  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  35.71 
 
 
283 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  33.22 
 
 
302 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  33.96 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  29.44 
 
 
317 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  29.27 
 
 
275 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  27.41 
 
 
271 aa  118  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.63 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.63 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.24 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.24 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  30.28 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.95 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.27 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  28.86 
 
 
269 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.17 
 
 
269 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.56 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  26.77 
 
 
269 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  28.57 
 
 
267 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.63 
 
 
277 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.53 
 
 
269 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
300 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  28.51 
 
 
273 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  27.35 
 
 
267 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.53 
 
 
270 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  25.69 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  25.69 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  25.69 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  25.48 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.59 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  28.99 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  24.8 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
293 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  25.4 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  27.31 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  28.86 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  28.86 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  28.86 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  28.05 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  28.86 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  26.02 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  27.76 
 
 
269 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  28.46 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.46 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  28.46 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  28.46 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.84 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  25.81 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  25.51 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.09 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.91 
 
 
283 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.62 
 
 
277 aa  92  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  27.65 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  25 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  26.99 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.64 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  25 
 
 
271 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  26.8 
 
 
271 aa  89  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  25.98 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  24.29 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  24.6 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  24.56 
 
 
326 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  25.48 
 
 
282 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  24.7 
 
 
289 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  28.24 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  25 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0968  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000856039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  25.98 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  23 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  26.69 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  25.88 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  26.27 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  25.62 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  21.85 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.67 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  25.2 
 
 
282 aa  82  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
282 aa  82  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  25.62 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  25.5 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  27.13 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  25.74 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  25.74 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  25.74 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  23.38 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.1 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  25.66 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.4 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.54 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.13 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000719078  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>