120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1726 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  51.16 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  51.2 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  46.8 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  44.18 
 
 		 293 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  45.6 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  49.41 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  45.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  44.8 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  47.43 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  47.6 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  44 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  41.51 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  46.8 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  44.32 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1348  Methyltransferase type 11  47.24 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0109621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  43.87 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  40.14 
 
 		 311 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  43.56 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  45.76 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  38.7 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.29 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  29.34 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4184  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  31.33 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.95 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  32.26 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  31.56 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  33.09 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  32.52 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  28.94 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  29.89 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  32.93 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  31.18 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.73 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  34.04 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.81 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.73 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  29.48 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  32.65 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.86 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.24 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  32.65 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.47 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  32.65 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  30 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  35.48 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  33.2 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  29.57 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  31.97 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  32.64 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  30.77 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.24 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  32.24 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  32.24 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  31.45 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  35.16 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  32.98 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.47 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  32.53 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  30.57 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  29.96 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  29.69 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  28.4 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  29.96 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  29.96 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  32.45 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  28.36 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  28.02 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  29.85 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  32.74 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  28.63 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  32.67 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  29.76 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  31.84 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  31.33 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  31.33 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  31.33 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  31.33 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.57 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.41 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  30.77 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.5 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.72 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.77 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  31.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.38 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.97 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  34.83 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.62 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  28.62 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.09 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27750  predicted protein  35.96 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.346942  normal  0.638554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  24.6 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.72 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>