176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3174 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  100 
 
 
277 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  47.23 
 
 
275 aa  261  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  46.64 
 
 
269 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  44.24 
 
 
317 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  43.54 
 
 
278 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.91 
 
 
269 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  42.91 
 
 
269 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  42.91 
 
 
269 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  42.91 
 
 
269 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  42.54 
 
 
269 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  42.59 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  42.59 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  42.59 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  41.79 
 
 
269 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  41.79 
 
 
269 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  41.79 
 
 
269 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  41.79 
 
 
269 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  42.75 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  40.89 
 
 
276 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  41.26 
 
 
276 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  43.02 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.54 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  40.74 
 
 
271 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  43.23 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  42.86 
 
 
269 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  42.86 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.55 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  42.86 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  42.86 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  39.34 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  40.29 
 
 
282 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.06 
 
 
274 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  40.82 
 
 
270 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  42.54 
 
 
286 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  37.27 
 
 
273 aa  208  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  41.04 
 
 
271 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  38.66 
 
 
271 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  39.93 
 
 
271 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  38.29 
 
 
271 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  39.55 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  38.58 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  38.58 
 
 
271 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.43 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  39.18 
 
 
271 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  38.41 
 
 
290 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  39.18 
 
 
271 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  39.85 
 
 
279 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.78 
 
 
267 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.84 
 
 
270 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.97 
 
 
283 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.2 
 
 
269 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.6 
 
 
270 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  36.4 
 
 
267 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  36.4 
 
 
267 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.4 
 
 
270 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34 
 
 
270 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.4 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 
294 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  33.6 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  37.2 
 
 
271 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.49 
 
 
313 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  31.72 
 
 
313 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.46 
 
 
285 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.84 
 
 
320 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.71 
 
 
283 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  29.87 
 
 
302 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.78 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.43 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2981  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.86 
 
 
279 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000243248  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.35 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0968  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.67 
 
 
277 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000856039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3078  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  29.86 
 
 
279 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000214385  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.78 
 
 
279 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000719078  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.47 
 
 
285 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1294  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  30.66 
 
 
275 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1162  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.23 
 
 
292 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000132162  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1081  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28 
 
 
298 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00250599  normal  0.0321173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.54 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.62 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  30.52 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.27 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1197  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  28.26 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1230  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  28.26 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.706376  normal  0.528023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  30.28 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  27.9 
 
 
280 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.53281  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1153  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  27.54 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.010967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.83 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  28.8 
 
 
281 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  29.28 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  27.6 
 
 
285 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  27.37 
 
 
326 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  31.01 
 
 
302 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  28.52 
 
 
289 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
274 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  27.02 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  29.57 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>