122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1634 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  50.2 
 
 
277 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  54.55 
 
 
295 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  52.22 
 
 
293 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  49.8 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  53.91 
 
 
289 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  51.97 
 
 
276 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  47.48 
 
 
311 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  52.38 
 
 
295 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  51.6 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  49.03 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  52.78 
 
 
282 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  51.19 
 
 
281 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  45.28 
 
 
326 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  49.62 
 
 
277 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  44.06 
 
 
281 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
283 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
292 aa  184  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  45.69 
 
 
302 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  45.34 
 
 
273 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1348  Methyltransferase type 11  46.85 
 
 
287 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0109621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4184  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
225 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  39.92 
 
 
285 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.82 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.21 
 
 
270 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.08 
 
 
270 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  33.84 
 
 
269 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  33.46 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  33.46 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  33.46 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  33.46 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.46 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  33.46 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  33.46 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.26 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  32.7 
 
 
269 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  35.14 
 
 
269 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.68 
 
 
274 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  35 
 
 
273 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  36.32 
 
 
276 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.14 
 
 
269 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.55 
 
 
270 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  36.78 
 
 
267 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  33.05 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.73 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  36.84 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.5 
 
 
270 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  35.53 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  31.42 
 
 
278 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  30.37 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  31.06 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  26.1 
 
 
271 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  29.75 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  29.57 
 
 
277 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.37 
 
 
272 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  35.62 
 
 
286 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  31.34 
 
 
279 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  31.34 
 
 
279 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  31.34 
 
 
279 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.45 
 
 
267 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.94 
 
 
283 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  32.9 
 
 
269 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  34.32 
 
 
283 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  32.9 
 
 
269 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  32.9 
 
 
269 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  32.9 
 
 
269 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  32.9 
 
 
269 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  28.68 
 
 
268 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  29.63 
 
 
282 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
282 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.04 
 
 
294 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  28.52 
 
 
273 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  26.77 
 
 
302 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.14 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  31.87 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  29.89 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.62 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  28.44 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  28.89 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  27.97 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  34.03 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  24.11 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  28.02 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  28.88 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  28.74 
 
 
271 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  28.45 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  27.14 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  27.66 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  27.48 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  28.45 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  28.93 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  26.22 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.2 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  29.55 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.92 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.27 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.97 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000719078  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>