41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2136 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  682    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2278  hypothetical protein  81.3 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  60.78 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  40.22 
 
 		 2272 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  38.71 
 
 		 2179 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  54.95 
 
 		 2313 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  45.83 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  45.61 
 
 		 1281 aa  56.6  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.61 
 
 		 2449 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2921  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.91 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0495483  normal  0.615191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  47.73 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1197 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.46 
 
 		 522 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.62 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.17 
 
 		 1888 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  44.44 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  45.68 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  41.67 
 
 		 484 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  36.84 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  36.96 
 
 		 555 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  34.65 
 
 		 551 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  30.53 
 
 		 840 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  68.42 
 
 		 764 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.41 
 
 		 830 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  54.64 
 
 		 2353 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  50 
 
 		 613 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  44 
 
 		 572 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  41.3 
 
 		 625 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  33.66 
 
 		 582 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.63 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  33.9 
 
 		 1088 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  50 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  50 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  35.35 
 
 		 521 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  42.05 
 
 		 926 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 		 673 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1261 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  39.29 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.16 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>