25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2278 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2278  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  664    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2136  hypothetical protein  86.67 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.36 
 
 		 2272 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.97 
 
 		 2179 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  57.35 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  43.1 
 
 		 1281 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33 
 
 		 2449 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2921  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.19 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0495483  normal  0.615191 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30 
 
 		 1888 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  56.63 
 
 		 2353 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.23 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  43.68 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79258  Myosin-5 isoform  29.59 
 
 		 1256 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  38.89 
 
 		 522 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  32.28 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.5 
 
 		 2313 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  38.55 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  42.53 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  51.95 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  37.84 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  33.87 
 
 		 2136 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.59 
 
 		 830 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.19 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  41.46 
 
 		 484 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  36.73 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>