193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0093 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0093  ExsB family protein  100 
 
 		 241 aa  503  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0207264  normal  0.133167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  34.68 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  29.28 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  30.97 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  30.04 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  29.57 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  28.82 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  28.82 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  28.82 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  27.9 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  29.26 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  27.39 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2927  ExsB family protein  30.74 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  29.78 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  31.53 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  27.68 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  27.71 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  27.51 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  27.63 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1000  exsB protein  26.87 
 
 		 464 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  30.3 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  28.57 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  29.41 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  29.34 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  28.39 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  28.57 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  31.44 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  30.47 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  29.18 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  28.51 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  27.75 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1261  exsB protein  29.44 
 
 		 502 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  29.61 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  27.27 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  32.29 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  27.51 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0547  exsB protein  25.53 
 
 		 469 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  25.97 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  27.51 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  28.88 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  28.83 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  28.76 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  29.07 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  25.97 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  25.97 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  25.66 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  27.95 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  28.38 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  27.98 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  28.05 
 
 		 484 aa  82  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2422  Queuosine synthesis-like protein  29.28 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  29.91 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  25.91 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  28.64 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  27.91 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  27.95 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  25.91 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  27.95 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  29.39 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  29.74 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  25.88 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  29.06 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  31.76 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  27.98 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  28.38 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  29.44 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  28.81 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  27.4 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  30.51 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  28.81 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  27.75 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  25.22 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  30.38 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  29.06 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  24.56 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  28.39 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  27.31 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  26.96 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  27.47 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  28.39 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  25.45 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  28.57 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  28.1 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1926  ExsB  24.67 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  26.79 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  26.18 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  25.11 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  29.31 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  27.62 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  25.85 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  25.85 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  28.15 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  26.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  25.85 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  25.85 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  28.38 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  23.71 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  23.58 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  29.31 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>