65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3242 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
233 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
233 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
234 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2347  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  29.69 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
172 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0847  phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0969821  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
180 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
172 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  31.67 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  26.87 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
177 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  28.15 
 
 
270 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  29.41 
 
 
271 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  25.95 
 
 
798 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
474 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
475 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  28.75 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
215 aa  45.1  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1302  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  0.0146938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1893  amidophosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  27.47 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
175 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
401 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2190  amidophosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
378 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
175 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
467 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1982  amidophosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
401 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.713553  normal  0.752655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
170 aa  42  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
190 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  23.12 
 
 
176 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 
233 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
170 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1852  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
193 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.897304  normal  0.461813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
190 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1315  adenine phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
182 aa  41.6  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000201282  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
148 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
468 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>