More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1893 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1893  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 381 aa  762    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2190  amidophosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0109  amidophosphoribosyltransferase  57.74 
 
 		 372 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1904  amidophosphoribosyltransferase  58.53 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.312869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0666  amidophosphoribosyltransferase  35.77 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1982  amidophosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.713553  normal  0.752655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1981  amidophosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 446 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.568591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 490 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  34.07 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 478 aa  136  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  32.27 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  30.55 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1694  amidophosphoribosyltransferase  31.52 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  28.15 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  32.27 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0518  amidophosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 458 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.842645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 517 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 499 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 502 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 470 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1942  amidophosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 493 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 497 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 497 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  29.39 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  30.47 
 
 		 493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 514 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 495 aa  129  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  33.75 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 496 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 487 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 513 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.96 
 
 		 459 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 505 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  28.04 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 467 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 482 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1863  amidophosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  33.47 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1191  amidophosphoribosyltransferase  32.13 
 
 		 485 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  33.21 
 
 		 527 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1328  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 502 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.159148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3759  amidophosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.041178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>