More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0109 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1904  amidophosphoribosyltransferase  87.63 
 
 
372 aa  657    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.312869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0109  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  743    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1893  amidophosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
381 aa  418  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2190  amidophosphoribosyltransferase  54.31 
 
 
378 aa  401  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0666  amidophosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
407 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1982  amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
401 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.713553  normal  0.752655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
514 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
474 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
563 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
474 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2437  amidophosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
504 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  32.71 
 
 
525 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1430  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
504 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1495  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
504 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.842806  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1483  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
504 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  30.24 
 
 
475 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1621  amidophosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
504 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.387036  normal  0.862121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2832  amidophosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
504 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
512 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2755  amidophosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
504 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3064  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
504 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
512 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2738  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
527 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
513 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1399  amidophosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
506 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
558 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1374  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
505 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2570  amidophosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
505 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1490  amidophosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
504 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
504 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2463  amidophosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
505 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
534 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
519 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3452  amidophosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2468  amidophosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
505 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
504 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02237  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1344  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0463785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2713  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0617498  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2604  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.841153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2690  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2504  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1340  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.889803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2606  amidophosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2550  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2592  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.210187  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02197  hypothetical protein  33.09 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2302  amidophosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
504 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  28.04 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19754  predicted protein  33.21 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2980  amidophosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.120272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  27.64 
 
 
503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1656  amidophosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00921285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02504  amidophosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2861  amidophosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.272913  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  32.55 
 
 
517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
515 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1981  amidophosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
446 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.568591  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
504 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  29.96 
 
 
468 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
502 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  32.01 
 
 
503 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
478 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
511 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1023  amidophosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
485 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
515 aa  132  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0899  amidophosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
485 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  29.35 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  29.24 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01960  amidophosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1535  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1426  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0355  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1688  amidophosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2793  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
623 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>