More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1982 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1982  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
401 aa  817    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.713553  normal  0.752655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  64.09 
 
 
401 aa  560  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
465 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  34.22 
 
 
475 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0666  amidophosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
407 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
473 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
473 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
479 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  35.7 
 
 
488 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
472 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
488 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
502 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
461 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
470 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  34.54 
 
 
503 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
496 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
472 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
496 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
493 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  41.08 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
519 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
488 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
500 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
513 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
492 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
478 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  35.41 
 
 
466 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
517 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
461 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
472 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
493 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
462 aa  230  4e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
476 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
515 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
447 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
515 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  34.89 
 
 
488 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
514 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
499 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
478 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
499 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
468 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
476 aa  227  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
502 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
563 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  32.97 
 
 
493 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
486 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
469 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  34.37 
 
 
480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
471 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
487 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
475 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
465 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
471 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
505 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
470 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
515 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
451 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
497 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
471 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
480 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
474 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
471 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1981  amidophosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.568591  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
497 aa  223  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
478 aa  223  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
514 aa  222  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
491 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
467 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
527 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
629 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  33.41 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
511 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  33.18 
 
 
503 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
456 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1694  amidophosphoribosyltransferase  34.32 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1191  amidophosphoribosyltransferase  33.26 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
470 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
474 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  34 
 
 
475 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
466 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
494 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
494 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
517 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
445 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>