More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2190 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2190  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
378 aa  755    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1893  amidophosphoribosyltransferase  61.27 
 
 
381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0109  amidophosphoribosyltransferase  54.31 
 
 
372 aa  401  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1904  amidophosphoribosyltransferase  54.97 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.312869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0666  amidophosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
407 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1982  amidophosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.713553  normal  0.752655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
401 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1981  amidophosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
446 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.568591  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
480 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  31.25 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
474 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
465 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
472 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
476 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
470 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  31 
 
 
479 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
470 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
474 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
495 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
506 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1328  amidophosphoribosyltransferase  35.39 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.159148  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
470 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
514 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
459 aa  133  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  27.84 
 
 
475 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
502 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
466 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1942  amidophosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
478 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
527 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
506 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0518  amidophosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.842645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
488 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
493 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  28.94 
 
 
503 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
519 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
629 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1694  amidophosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
450 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
563 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
514 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
504 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2683  amidophosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
501 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
454 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
525 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
472 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
505 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
477 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
445 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1863  amidophosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
501 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308686  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
445 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
508 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
474 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  31.35 
 
 
506 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4402  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
501 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3563  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
510 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
512 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
503 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
496 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
478 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1023  amidophosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
485 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
497 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
488 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>