More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2302 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  63.34 
 
 		 511 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02237  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1344  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0463785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2000  amidophosphoribosyltransferase  62.87 
 
 		 501 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  63.67 
 
 		 502 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1656  amidophosphoribosyltransferase  89.48 
 
 		 504 aa  958    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00921285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3798  amidophosphoribosyltransferase  72.26 
 
 		 505 aa  763    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2025  amidophosphoribosyltransferase  63.07 
 
 		 501 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1534  amidophosphoribosyltransferase  62.28 
 
 		 501 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.609043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3064  amidophosphoribosyltransferase  89.68 
 
 		 504 aa  934    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3811  amidophosphoribosyltransferase  62.35 
 
 		 502 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2606  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  73.51 
 
 		 504 aa  761    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  62.87 
 
 		 501 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2980  amidophosphoribosyltransferase  88.49 
 
 		 504 aa  944    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.120272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1668  amidophosphoribosyltransferase  62.35 
 
 		 502 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.416229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1282  amidophosphoribosyltransferase  62.4 
 
 		 511 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.734228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34150  amidophosphoribosyltransferase  63.67 
 
 		 501 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0525  amidophosphoribosyltransferase  74.1 
 
 		 504 aa  770    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1259  amidophosphoribosyltransferase  64.02 
 
 		 503 aa  668    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  62.67 
 
 		 503 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1902  amidophosphoribosyltransferase  63.47 
 
 		 501 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2690  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  773    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2604  amidophosphoribosyltransferase  74.75 
 
 		 505 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.841153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1080  amidophosphoribosyltransferase  73.05 
 
 		 504 aa  754    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002879  amidophosphoribosyltransferase  73.11 
 
 		 504 aa  759    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 503 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2463  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2738  amidophosphoribosyltransferase  89.48 
 
 		 504 aa  934    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1471  amidophosphoribosyltransferase  74.55 
 
 		 505 aa  770    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  73.76 
 
 		 505 aa  771    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  88.69 
 
 		 504 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2793  amidophosphoribosyltransferase  74.55 
 
 		 505 aa  770    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2302  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 504 aa  1044    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1535  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2832  amidophosphoribosyltransferase  89.48 
 
 		 504 aa  934    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01960  amidophosphoribosyltransferase  70.36 
 
 		 473 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2072  amidophosphoribosyltransferase  64.2 
 
 		 504 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.729582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2592  amidophosphoribosyltransferase  74.75 
 
 		 505 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.210187  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1692  amidophosphoribosyltransferase  66 
 
 		 511 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3452  amidophosphoribosyltransferase  74.55 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1490  amidophosphoribosyltransferase  87.3 
 
 		 504 aa  922    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1621  amidophosphoribosyltransferase  89.48 
 
 		 504 aa  934    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.387036  normal  0.862121 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02197  hypothetical protein  74.35 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1267  amidophosphoribosyltransferase  62.75 
 
 		 506 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0479924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1103  amidophosphoribosyltransferase  62.6 
 
 		 511 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0368  amidophosphoribosyltransferase  67.73 
 
 		 472 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.780297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  60.91 
 
 		 504 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1374  amidophosphoribosyltransferase  73.36 
 
 		 505 aa  760    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1340  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.889803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1153  amidophosphoribosyltransferase  62.83 
 
 		 506 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0456137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2861  amidophosphoribosyltransferase  73.36 
 
 		 505 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.272913  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2713  amidophosphoribosyltransferase  74.75 
 
 		 505 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0617498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1609  amidophosphoribosyltransferase  71.12 
 
 		 505 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1426  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0916  amidophosphoribosyltransferase  70.04 
 
 		 504 aa  718    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0355  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  775    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1430  amidophosphoribosyltransferase  90.08 
 
 		 504 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1495  amidophosphoribosyltransferase  90.08 
 
 		 504 aa  939    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.842806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1242  amidophosphoribosyltransferase  62.04 
 
 		 504 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.520504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1399  amidophosphoribosyltransferase  89.29 
 
 		 504 aa  943    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2468  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 505 aa  772    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2755  amidophosphoribosyltransferase  89.48 
 
 		 504 aa  934    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23920  amidophosphoribosyltransferase  63.07 
 
 		 501 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  63.14 
 
 		 511 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2550  amidophosphoribosyltransferase  74.75 
 
 		 505 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2437  amidophosphoribosyltransferase  89.29 
 
 		 504 aa  936    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2570  amidophosphoribosyltransferase  73.96 
 
 		 505 aa  762    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1483  amidophosphoribosyltransferase  89.68 
 
 		 504 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1552  amidophosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 507 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3761  amidophosphoribosyltransferase  62.67 
 
 		 501 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2504  amidophosphoribosyltransferase  74.75 
 
 		 505 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  87.7 
 
 		 504 aa  928    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2711  amidophosphoribosyltransferase  64.03 
 
 		 502 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.966551  normal  0.266296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1965  amidophosphoribosyltransferase  67.33 
 
 		 504 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.960535  normal  0.602914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  62.11 
 
 		 511 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1328  amidophosphoribosyltransferase  63.71 
 
 		 502 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.159148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2048  amidophosphoribosyltransferase  62.5 
 
 		 502 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.854474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  64.07 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0936  amidophosphoribosyltransferase  61.84 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0686  amidophosphoribosyltransferase  61.9 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6835  amidophosphoribosyltransferase  60.66 
 
 		 516 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661611  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  61.36 
 
 		 508 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0762  amidophosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2300  amidophosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2438  amidophosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1043  amidophosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.603388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1714  amidophosphoribosyltransferase  61.08 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2118  amidophosphoribosyltransferase  61.7 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0778  amidophosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 512 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000128601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2874  amidophosphoribosyltransferase  60.66 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.352356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  59.92 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1656  amidophosphoribosyltransferase  61.08 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4615  amidophosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.257725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  61.7 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0536  amidophosphoribosyltransferase  61.08 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  61.7 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  61.08 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3056  amidophosphoribosyltransferase  60.82 
 
 		 511 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 510 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>