56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1567 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2348  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2347  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0695  phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0847  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0969821  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
175 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  30.33 
 
 
274 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  32.8 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  32.8 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0140  adenine phosphoribosyltransferase, putative  32.85 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  32 
 
 
274 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
180 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  29.27 
 
 
282 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  29.27 
 
 
282 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  31.88 
 
 
278 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  28.69 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
172 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  30.08 
 
 
282 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  29.27 
 
 
282 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  27.59 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.02 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  24.63 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
170 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  26.28 
 
 
280 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 
185 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
170 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>