21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4613 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  69.7 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  67.53 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  29.7 
 
 		 798 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3159  Uracil phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2912  Uracil phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2347  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 190 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>