89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3151 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  89.66 
 
 
234 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  67.53 
 
 
233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
228 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1852  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
193 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.897304  normal  0.461813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1845  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
193 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.658396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2427  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1302  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  0.0146938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3159  Uracil phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
179 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
189 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
181 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
189 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
181 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 
173 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3762  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
169 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
184 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05091  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
183 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14720  pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
194 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2400  Uracil phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2403  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646924  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1879  Uracil phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.812651  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4568  Uracil phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.285622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2362  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0751528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2409  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.289771  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0071  Uracil phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0813  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1364  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0131251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0842  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  22.14 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1464  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1319  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2748  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3168  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2676  phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1995  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.432964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  27.13 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3203  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.184553  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3110  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3146  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0918  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1857  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
178 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1351  Uracil phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2334  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
170 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.810966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0611  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
178 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0416162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0467  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2004  Uracil phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000110086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2804  Uracil phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
185 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
172 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0504  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0748289  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1672  adenine phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1819  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.227528  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  30.43 
 
 
798 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  32 
 
 
186 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  29.61 
 
 
278 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1675  Uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320404  normal  0.0117942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3149  Uracil phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
186 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15511  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
183 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.403665  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0140  adenine phosphoribosyltransferase, putative  38.04 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2540  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 
180 aa  41.6  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>