82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3441 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  89.66 
 
 
233 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  69.7 
 
 
233 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
228 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1852  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.897304  normal  0.461813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
185 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1845  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.658396  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2427  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
184 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3159  Uracil phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
179 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
184 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0842  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
175 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0813  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
175 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
181 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1302  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  0.0146938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
175 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1857  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3146  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3110  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1995  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.432964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2748  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0918  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3168  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1675  Uracil phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320404  normal  0.0117942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  22.36 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1464  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0504  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0748289  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3762  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09350  Uracil phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.724521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3149  Uracil phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2540  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  32 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1879  Uracil phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.812651  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05091  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
181 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2313  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
177 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
180 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0611  phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0416162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1042  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
179 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3936  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000824231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
179 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  28.57 
 
 
798 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4568  Uracil phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
174 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.285622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0467  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
172 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2400  Uracil phosphoribosyltransferase  28 
 
 
189 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
176 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
205 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11840  pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
195 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  hitchhiker  0.00347451 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
172 aa  41.6  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
175 aa  41.6  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
179 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  52.63 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
179 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
170 aa  41.6  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>