52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2347 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2347  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0695  phosphoribosyltransferase  71.51 
 
 
178 aa  261  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0847  phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
286 aa  173  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0969821  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
176 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2348  phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
180 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
228 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  23.31 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
170 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
170 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
180 aa  44.3  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  25.17 
 
 
281 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  26.52 
 
 
278 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1315  adenine phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
182 aa  42  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000201282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1201  adenine phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  0.998677 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 
173 aa  42  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
171 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
181 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0140  adenine phosphoribosyltransferase, putative  34.74 
 
 
215 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1189  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  27.33 
 
 
277 aa  41.6  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  28.68 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  26.03 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.2 
 
 
322 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  26.32 
 
 
274 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  24.82 
 
 
284 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>