More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3118 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.89 
 
 
815 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.62 
 
 
816 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.75 
 
 
816 aa  800    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  48.37 
 
 
836 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.25 
 
 
816 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  68.69 
 
 
801 aa  1111    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.51 
 
 
815 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  46.39 
 
 
836 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  42.72 
 
 
817 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.45 
 
 
828 aa  686    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.76 
 
 
817 aa  738    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  54.18 
 
 
816 aa  816    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  45.89 
 
 
815 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  45.16 
 
 
801 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.59 
 
 
839 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  52.01 
 
 
812 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  54.18 
 
 
816 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.17 
 
 
815 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.27 
 
 
870 aa  799    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.07 
 
 
848 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1359  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.19 
 
 
843 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  45.86 
 
 
837 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.31 
 
 
831 aa  758    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.3 
 
 
822 aa  701    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.16 
 
 
801 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.23 
 
 
816 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  68.69 
 
 
801 aa  1111    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  42.16 
 
 
876 aa  645    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.62 
 
 
840 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.53 
 
 
838 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.99 
 
 
835 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.21 
 
 
817 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  50.06 
 
 
835 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1989  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.68 
 
 
848 aa  782    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3798  maltodextrin phosphorylase  46.15 
 
 
797 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.910266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
818 aa  666    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.63 
 
 
816 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.16 
 
 
844 aa  678    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.6 
 
 
826 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.73 
 
 
834 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.58 
 
 
837 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.85 
 
 
841 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.07 
 
 
843 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.12 
 
 
836 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.73 
 
 
807 aa  832    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.25 
 
 
842 aa  757    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
793 aa  1632    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.12 
 
 
815 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.02 
 
 
840 aa  778    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.75 
 
 
838 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.25 
 
 
846 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.25 
 
 
846 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  47.34 
 
 
817 aa  737    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.25 
 
 
838 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.93 
 
 
831 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.78 
 
 
864 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.81 
 
 
894 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3830  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.7 
 
 
797 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  45.89 
 
 
815 aa  707    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.24 
 
 
831 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.07 
 
 
843 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  45.5 
 
 
819 aa  704    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.59 
 
 
850 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.21 
 
 
849 aa  680    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.68 
 
 
837 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.43 
 
 
837 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.49 
 
 
859 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  52.26 
 
 
812 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.77 
 
 
801 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.53 
 
 
821 aa  822    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  67.3 
 
 
801 aa  1098    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  43.51 
 
 
820 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.91 
 
 
832 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.05 
 
 
838 aa  680    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.86 
 
 
829 aa  697    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  45.76 
 
 
797 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.68 
 
 
837 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.01 
 
 
842 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.54 
 
 
829 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53 
 
 
838 aa  789    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  60.5 
 
 
798 aa  954    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  43.55 
 
 
817 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  46.55 
 
 
815 aa  710    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.13 
 
 
827 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  41.32 
 
 
834 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.62 
 
 
840 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2028  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.44 
 
 
844 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550942  normal  0.926011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.37 
 
 
823 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.17 
 
 
808 aa  700    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>