More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4861 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  46.88 
 
 
879 aa  697    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  46.66 
 
 
797 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  49 
 
 
815 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49 
 
 
815 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.66 
 
 
797 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  46.04 
 
 
813 aa  694    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  59.95 
 
 
816 aa  982    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  49.94 
 
 
836 aa  762    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  59.83 
 
 
816 aa  979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  49.31 
 
 
815 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  49.44 
 
 
832 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  49.88 
 
 
836 aa  721    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.94 
 
 
828 aa  782    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  47.62 
 
 
837 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  59.58 
 
 
816 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  49 
 
 
815 aa  775    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  46.66 
 
 
797 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  46.85 
 
 
817 aa  702    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.45 
 
 
839 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  59.58 
 
 
816 aa  983    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.58 
 
 
842 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.02 
 
 
838 aa  966    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  46.4 
 
 
839 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.48 
 
 
848 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  49.81 
 
 
837 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  68.11 
 
 
831 aa  1137    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72279  Releases glucose-1-phosphate from glycogen  44.38 
 
 
896 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.93 
 
 
833 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.07 
 
 
816 aa  979    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  48.46 
 
 
801 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.06 
 
 
834 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.11 
 
 
840 aa  692    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.07 
 
 
840 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.92 
 
 
838 aa  761    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.18 
 
 
835 aa  703    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  81 
 
 
835 aa  1368    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.29 
 
 
836 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.88 
 
 
823 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.97 
 
 
833 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  49 
 
 
815 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  45.57 
 
 
848 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.5 
 
 
844 aa  773    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.12 
 
 
826 aa  769    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  44.62 
 
 
876 aa  690    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.06 
 
 
801 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.62 
 
 
841 aa  743    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.96 
 
 
823 aa  970    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  85.66 
 
 
836 aa  1486    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58 
 
 
807 aa  945    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  46.07 
 
 
841 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.75 
 
 
793 aa  765    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.38 
 
 
815 aa  746    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.97 
 
 
843 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  46.02 
 
 
816 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
838 aa  1722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.75 
 
 
846 aa  789    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.75 
 
 
846 aa  789    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  53.32 
 
 
817 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  84.71 
 
 
838 aa  1494    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  67.24 
 
 
831 aa  1128    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.92 
 
 
842 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.03 
 
 
894 aa  711    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  45.9 
 
 
854 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  46.66 
 
 
797 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  44.36 
 
 
820 aa  709    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.38 
 
 
831 aa  758    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.97 
 
 
843 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  45.42 
 
 
811 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  58.71 
 
 
812 aa  934    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  47.99 
 
 
819 aa  748    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.5 
 
 
850 aa  754    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.44 
 
 
849 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.1 
 
 
837 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.85 
 
 
837 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.76 
 
 
838 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  59.38 
 
 
812 aa  943    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.04 
 
 
818 aa  685    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  56.93 
 
 
821 aa  942    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  45.17 
 
 
801 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.82 
 
 
829 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.31 
 
 
832 aa  778    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.31 
 
 
838 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.06 
 
 
829 aa  760    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.14 
 
 
824 aa  742    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.1 
 
 
837 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.37 
 
 
837 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.57 
 
 
833 aa  759    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.16 
 
 
829 aa  746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  47.35 
 
 
817 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.43 
 
 
798 aa  762    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.46 
 
 
801 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2451  phosphorylase  45.29 
 
 
824 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.63 
 
 
815 aa  765    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.78 
 
 
834 aa  728    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.43 
 
 
840 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.93 
 
 
827 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  46.07 
 
 
848 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  46.4 
 
 
839 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  51.23 
 
 
808 aa  787    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  46.07 
 
 
854 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>