More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  44.3 
 
 
879 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  47.82 
 
 
815 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.82 
 
 
815 aa  761    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.57 
 
 
815 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  45.8 
 
 
813 aa  705    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  59.98 
 
 
835 aa  963    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  47.54 
 
 
836 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  70.69 
 
 
816 aa  1190    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.44 
 
 
818 aa  699    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  47.85 
 
 
832 aa  727    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  47.78 
 
 
836 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  47.82 
 
 
815 aa  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
828 aa  735    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  46.01 
 
 
837 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  71.07 
 
 
816 aa  1190    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.33 
 
 
864 aa  697    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  47.82 
 
 
815 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  45.86 
 
 
817 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  43.46 
 
 
801 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  71.45 
 
 
816 aa  1194    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  44.92 
 
 
854 aa  675    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.37 
 
 
834 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  45.52 
 
 
839 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.63 
 
 
848 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  44.57 
 
 
854 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  46.97 
 
 
837 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.26 
 
 
831 aa  936    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.95 
 
 
839 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.08 
 
 
833 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  72.07 
 
 
816 aa  1193    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  50.68 
 
 
801 aa  768    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.68 
 
 
808 aa  758    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.59 
 
 
840 aa  664    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.41 
 
 
840 aa  676    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.2 
 
 
838 aa  742    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.05 
 
 
835 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
842 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  46.61 
 
 
817 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.35 
 
 
823 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.05 
 
 
833 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.04 
 
 
801 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  44.92 
 
 
848 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.83 
 
 
844 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.57 
 
 
826 aa  763    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  48.28 
 
 
815 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  42.87 
 
 
876 aa  663    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.44 
 
 
841 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  71.67 
 
 
816 aa  1204    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  57.53 
 
 
836 aa  942    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  61.02 
 
 
807 aa  971    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
843 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.26 
 
 
793 aa  770    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.06 
 
 
815 aa  769    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.68 
 
 
801 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  45.96 
 
 
816 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  59.38 
 
 
838 aa  962    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.49 
 
 
846 aa  793    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.49 
 
 
846 aa  793    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  50.99 
 
 
817 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.48 
 
 
838 aa  950    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.43 
 
 
831 aa  945    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.88 
 
 
842 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.82 
 
 
894 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  45.65 
 
 
841 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  45.29 
 
 
848 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  45.19 
 
 
820 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.59 
 
 
831 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  45.52 
 
 
839 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
843 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  43.89 
 
 
811 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  97.17 
 
 
812 aa  1572    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  47.91 
 
 
819 aa  754    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.24 
 
 
850 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.85 
 
 
849 aa  740    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.01 
 
 
837 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.15 
 
 
837 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.91 
 
 
838 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  100 
 
 
812 aa  1652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  41.06 
 
 
800 aa  643    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  61.13 
 
 
821 aa  992    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  73.5 
 
 
823 aa  1217    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.28 
 
 
815 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.26 
 
 
832 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.64 
 
 
838 aa  749    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.38 
 
 
829 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.97 
 
 
824 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.4 
 
 
837 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.57 
 
 
838 aa  955    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.87 
 
 
833 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.61 
 
 
829 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.81 
 
 
829 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  51.73 
 
 
798 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.13 
 
 
837 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2451  phosphorylase  45.92 
 
 
824 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.69 
 
 
836 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.16 
 
 
834 aa  714    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.65 
 
 
840 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72279  Releases glucose-1-phosphate from glycogen  43.08 
 
 
896 aa  675    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.03 
 
 
827 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.68 
 
 
801 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>