More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4429 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2028  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.88 
 
 		 844 aa  802    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550942  normal  0.926011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.98 
 
 		 834 aa  727    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  48.56 
 
 		 836 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.74 
 
 		 816 aa  811    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  47.43 
 
 		 841 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  45.78 
 
 		 832 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  51.01 
 
 		 836 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47 
 
 		 828 aa  719    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.51 
 
 		 801 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  52.81 
 
 		 816 aa  807    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.28 
 
 		 839 aa  730    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  47.05 
 
 		 815 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  52.2 
 
 		 812 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  52.68 
 
 		 816 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  45.93 
 
 		 817 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  46 
 
 		 839 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.32 
 
 		 848 aa  695    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3830  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.68 
 
 		 815 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  46.8 
 
 		 837 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.62 
 
 		 831 aa  801    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.52 
 
 		 833 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.09 
 
 		 816 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  62.2 
 
 		 801 aa  1000    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.91 
 
 		 815 aa  692    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.66 
 
 		 827 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.25 
 
 		 840 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  45.03 
 
 		 848 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.71 
 
 		 840 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.18 
 
 		 838 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.94 
 
 		 835 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.93 
 
 		 823 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17241  phosphorylase  45.25 
 
 		 840 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.33 
 
 		 823 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  47.86 
 
 		 797 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.7 
 
 		 818 aa  704    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  44.91 
 
 		 848 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.67 
 
 		 844 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.98 
 
 		 826 aa  722    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.73 
 
 		 808 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.98 
 
 		 797 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.69 
 
 		 841 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  44.91 
 
 		 854 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.42 
 
 		 836 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.99 
 
 		 807 aa  800    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.41 
 
 		 829 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.5 
 
 		 793 aa  967    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.25 
 
 		 815 aa  695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.05 
 
 		 815 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.43 
 
 		 838 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.25 
 
 		 846 aa  755    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.25 
 
 		 846 aa  755    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  47.8 
 
 		 817 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.49 
 
 		 838 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.44 
 
 		 831 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.1 
 
 		 842 aa  643    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.96 
 
 		 894 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  43.49 
 
 		 876 aa  656    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.32 
 
 		 838 aa  803    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.47 
 
 		 831 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  62.2 
 
 		 801 aa  1000    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  45.43 
 
 		 817 aa  686    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.03 
 
 		 815 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  45.26 
 
 		 819 aa  687    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.24 
 
 		 850 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.17 
 
 		 849 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53 
 
 		 870 aa  810    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.11 
 
 		 816 aa  815    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  47.05 
 
 		 815 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  51.73 
 
 		 812 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  48.51 
 
 		 801 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.34 
 
 		 821 aa  827    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.77 
 
 		 864 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  46 
 
 		 839 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.11 
 
 		 832 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.73 
 
 		 838 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.32 
 
 		 829 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.7 
 
 		 824 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.43 
 
 		 840 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.87 
 
 		 816 aa  814    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.3 
 
 		 833 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.94 
 
 		 829 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  51.62 
 
 		 835 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.61 
 
 		 816 aa  820    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  100 
 
 		 798 aa  1626    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.74 
 
 		 837 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.84 
 
 		 801 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  62.55 
 
 		 801 aa  1008    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.57 
 
 		 834 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.41 
 
 		 840 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  44.78 
 
 		 854 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>