More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0067 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  46.71 
 
 		 879 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.202732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  49.3 
 
 		 797 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  49.13 
 
 		 815 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.13 
 
 		 815 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.3 
 
 		 797 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  46.34 
 
 		 813 aa  725    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  47.59 
 
 		 876 aa  717    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  51.67 
 
 		 836 aa  804    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.19 
 
 		 816 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  48.8 
 
 		 817 aa  773    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  44.33 
 
 		 817 aa  676    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  100 
 
 		 832 aa  1724    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  51.63 
 
 		 836 aa  778    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  44.42 
 
 		 802 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.99 
 
 		 828 aa  812    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  50.84 
 
 		 837 aa  746    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  47.06 
 
 		 816 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  44.54 
 
 		 802 aa  675    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  44.42 
 
 		 802 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  44.54 
 
 		 802 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  47.08 
 
 		 801 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  47.43 
 
 		 816 aa  746    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  49.69 
 
 		 835 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  56.35 
 
 		 839 aa  895    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.39 
 
 		 848 aa  1012    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  54.69 
 
 		 854 aa  889    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  48.61 
 
 		 820 aa  730    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  52.11 
 
 		 837 aa  770    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.87 
 
 		 831 aa  727    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.38 
 
 		 801 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.58 
 
 		 833 aa  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.68 
 
 		 816 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  44.38 
 
 		 801 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.93 
 
 		 834 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.08 
 
 		 840 aa  936    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.08 
 
 		 840 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.17 
 
 		 838 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.65 
 
 		 835 aa  791    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  56.47 
 
 		 841 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.27 
 
 		 801 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  53.08 
 
 		 823 aa  817    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.51 
 
 		 833 aa  760    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  44.54 
 
 		 802 aa  675    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  54.81 
 
 		 848 aa  901    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.7 
 
 		 844 aa  900    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.43 
 
 		 826 aa  819    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  56.35 
 
 		 839 aa  895    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  64.5 
 
 		 829 aa  1050    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  56.43 
 
 		 841 aa  876    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.88 
 
 		 815 aa  749    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.5 
 
 		 836 aa  757    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.18 
 
 		 807 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3830  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.85 
 
 		 797 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.27 
 
 		 815 aa  750    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  47.73 
 
 		 812 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  50.58 
 
 		 816 aa  737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.94 
 
 		 838 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.41 
 
 		 846 aa  876    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.41 
 
 		 846 aa  876    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  48.94 
 
 		 817 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.38 
 
 		 838 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.17 
 
 		 831 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.36 
 
 		 842 aa  742    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.09 
 
 		 894 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.55 
 
 		 842 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.19 
 
 		 843 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72279  Releases glucose-1-phosphate from glycogen  44.75 
 
 		 896 aa  689    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.31 
 
 		 831 aa  814    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  54.81 
 
 		 854 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.75 
 
 		 843 aa  741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  47.53 
 
 		 811 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.21 
 
 		 802 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  46.05 
 
 		 819 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  57.55 
 
 		 850 aa  953    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  57.83 
 
 		 849 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.21 
 
 		 837 aa  745    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.09 
 
 		 837 aa  744    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.84 
 
 		 838 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  47.85 
 
 		 812 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  57.18 
 
 		 839 aa  894    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.55 
 
 		 821 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.98 
 
 		 827 aa  999    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.69 
 
 		 816 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  62.94 
 
 		 832 aa  1052    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  64.29 
 
 		 838 aa  1073    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.83 
 
 		 829 aa  802    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.83 
 
 		 824 aa  773    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.21 
 
 		 837 aa  745    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.94 
 
 		 838 aa  733    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  61.82 
 
 		 833 aa  1025    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50 
 
 		 829 aa  793    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  54.57 
 
 		 848 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.39 
 
 		 798 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  64.35 
 
 		 837 aa  1080    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2451  phosphorylase  50.77 
 
 		 824 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.16 
 
 		 836 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.16 
 
 		 834 aa  787    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  60.25 
 
 		 840 aa  991    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.42 
 
 		 823 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.51 
 
 		 808 aa  752    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>