32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2320 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  59.41 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  47.17 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  46.56 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  47.08 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  37.37 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  36.07 
 
 		 201 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  38.17 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  33.81 
 
 		 211 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  37.43 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  32.16 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  31.82 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  29.83 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  22.84 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 		 577 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  23.61 
 
 		 541 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  26.79 
 
 		 541 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  26.79 
 
 		 541 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  26.79 
 
 		 541 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  26.79 
 
 		 541 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  24.81 
 
 		 542 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  22.92 
 
 		 544 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  22.22 
 
 		 544 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  29.29 
 
 		 609 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  22.92 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  22.92 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  23.31 
 
 		 542 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  22.92 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.89 
 
 		 545 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  22.92 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  26.32 
 
 		 545 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>