20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2228 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  56.38 
 
 
203 aa  241  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  52.58 
 
 
206 aa  222  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  58.19 
 
 
199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  47.21 
 
 
211 aa  190  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  42.78 
 
 
206 aa  168  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  45.45 
 
 
206 aa  161  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  39.53 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.07 
 
 
291 aa  142  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.36 
 
 
304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  34.17 
 
 
319 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.66 
 
 
318 aa  121  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  28.87 
 
 
304 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  25.27 
 
 
292 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  27.14 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  28.43 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0284  hypothetical protein  27.32 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.616182  hitchhiker  0.00257716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  25.37 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0353  hypothetical protein  25.63 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0563  hypothetical protein  25.85 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.173051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>