17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1913 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  52.1 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  49.54 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  47.26 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  46.25 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  33.45 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  34.18 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  29.9 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  31.47 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.97 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  34.21 
 
 		 201 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  29.9 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  30.94 
 
 		 206 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  29.08 
 
 		 206 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  26.02 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  25.17 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  21.71 
 
 		 542 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>