15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1704 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  411  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  49.26 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  50 
 
 
206 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  39.53 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  39.09 
 
 
206 aa  151  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  38.94 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  47.67 
 
 
199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  41.45 
 
 
203 aa  138  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  35.32 
 
 
304 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  33.51 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  34.21 
 
 
304 aa  104  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.81 
 
 
319 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.48 
 
 
318 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  27.32 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  25.68 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>