19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1735 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 
304 aa  606  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  59.08 
 
 
291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  51.1 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  52.65 
 
 
319 aa  299  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  52.27 
 
 
304 aa  291  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  37.5 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  35.32 
 
 
201 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  39.9 
 
 
206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  38.07 
 
 
199 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  31.84 
 
 
206 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  33.52 
 
 
206 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  29.76 
 
 
203 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  26.7 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  23 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0563  hypothetical protein  23.5 
 
 
198 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.173051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0284  hypothetical protein  23.5 
 
 
198 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.616182  hitchhiker  0.00257716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1653  hypothetical protein  28.47 
 
 
180 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.414562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>