15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2254 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 
319 aa  644    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  78.37 
 
 
318 aa  490  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  52.98 
 
 
304 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  48.62 
 
 
304 aa  287  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  47.02 
 
 
291 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.99 
 
 
292 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  36.18 
 
 
201 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  30.67 
 
 
211 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.82 
 
 
199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  30.69 
 
 
206 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  30.98 
 
 
201 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  23.44 
 
 
198 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>