20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0467 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  62.93 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  64.29 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  56.84 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  53.17 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  46.29 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  47.55 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  47.4 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  37.17 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.98 
 
 		 304 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.37 
 
 		 319 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.09 
 
 		 304 aa  117  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.77 
 
 		 292 aa  114  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.43 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  27.37 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  27.63 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0284  hypothetical protein  25.79 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.616182  hitchhiker  0.00257716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0353  hypothetical protein  26.18 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0563  hypothetical protein  25.65 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.173051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  25.26 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>