17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0589 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  56.44 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  62.93 
 
 
199 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  54.15 
 
 
211 aa  225  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  52.58 
 
 
201 aa  222  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  43.15 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  45.25 
 
 
206 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  39.09 
 
 
201 aa  151  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  38.17 
 
 
291 aa  141  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  39.9 
 
 
304 aa  134  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  31.73 
 
 
319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.96 
 
 
304 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  29.38 
 
 
318 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  26.56 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  27.6 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  26.02 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  25.39 
 
 
198 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>