16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0084 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  66.02 
 
 
206 aa  296  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  43.15 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  46.29 
 
 
199 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  41.38 
 
 
203 aa  158  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  39.02 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  31.82 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  33.52 
 
 
304 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  28.84 
 
 
319 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  29.1 
 
 
304 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  27.14 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  25.28 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  25 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  23.81 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>