20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0557 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  56.44 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  56.38 
 
 
201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  64.29 
 
 
199 aa  238  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  47.17 
 
 
211 aa  195  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  41.38 
 
 
206 aa  158  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  45.2 
 
 
206 aa  154  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  41.45 
 
 
201 aa  138  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  32.16 
 
 
291 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  29.76 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  28.5 
 
 
319 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  29.41 
 
 
304 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  26.64 
 
 
318 aa  97.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  26.15 
 
 
292 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  24.08 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1496  protein of unknown function DUF106 transmembrane  25.41 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.939941  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  25.26 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0353  hypothetical protein  26.84 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0284  hypothetical protein  24.74 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.616182  hitchhiker  0.00257716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0563  hypothetical protein  24.61 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.173051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>