17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0563 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0563  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.173051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0284  hypothetical protein  96.97 
 
 
198 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.616182  hitchhiker  0.00257716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1629  hypothetical protein  95.45 
 
 
198 aa  336  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0353  hypothetical protein  86.87 
 
 
198 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  69.19 
 
 
198 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  32.16 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  25.63 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  24.61 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  23.5 
 
 
304 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  22.67 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  22.45 
 
 
304 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  26.18 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  24.63 
 
 
291 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  25.29 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  30.48 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>